La presente investigación se llevó a cabo con el propósito de crear la línea de base, que permita evaluar a través del tiempo, los cambios generados en la composición de la comunidad íctica del Delta del Río Magdalena, apartir de la construcción y funcionamiento de las obras hidráulicas tendientes a la comunicación del Río Magdalena con el Complejo Lagunar. las muestras fueron tomadas mensualmente durante un año (marzo/95-febrero/96), en tres sectores del Delta con diferente estado de conservación ambiental: El Complejo de Pajarales (CP) (sitio de mayor deterioro). La Ciénaga Grande de Santa Marta (CGSM) (estado intermedio), y un grupo de ciénagas ubicadas en la margen occidental de la Isla de Salamanca (CSO). En cada sector se escogieron 5 estaciones de muestreo en las que se midieron variables físico-químicas y se utilizó pare la pesca dos atarrayas con diferente ojo de malla (3 y 6.3 cm, respectivamente). Se obtuvo un total de 3411 individuos pertenecientes a 25 familias y 57 especies, que representaron en biomasa total 133 k (peso fresco). Las especies más abundantes fueron Anchovia clupeoides (bocona) y Eugerres plumieri (mojarra rayada) que aportaron el 60o/o de la captura total; el 51o/o de biomasa correspondió a Mugil incilis (lisa), E. plumieri y Ariopsis bonillai (chivo cabezón), especies que son consideradas como las de mayor importancia comercial en el área. La mayor abundancia y biomasa se presentaron durante el período lluvioso mayor (octubre a diciembre/95) e inicio de la temporada seca (enero/96), época que coincide con los períodos de reproducción de las lisas, mojarras y chivos. Mediante el análisis realizado en cada sector se determinó que existe una mayor abundancia y biomasa en CP (41o/o y 39o/o respectivamente); el índice de diversidad de Shgannon y Weaver, así como las curvas de K-dominancia mostraron que la mayor diversidad se encuentra en CSO. A partir del índice de Bray-Curtis se estableció que son más similares entre si, los sectores CGSM y C SO, producto de la mayor influencia del mar y el agua dulce, corroborándose en parte la hipótesis de trabajo. Se destaca la presencia en CGSM y CP de un gran porcentaje de especies de agua dulce (15 y 41 o/o respectivamente), que no se habían registrado en los últimos cinco años, entre ellas espacies comerciales como Prochilodus magdalenae (bocachico) y Caquetaia kraussi (mojarra amarilla); además fueron frecuentes especies foráneas como Oreochromis niloticus (tilapia) y Trychogaster pectoralis (terapia), provenientes en gran parte del Río Magdalena. La presencia de gran cantidad de espeecies ocasionales y frecuentes, tanto de agua dulce como marina, en contraste con pocas especies residentes en los tres sectores, manifiestan la caracterización ecológica de los ecosistemas. Los resultados del presente estudio se constituyen en información básica, parte las entidades encargadas de la adopción de medidas de manejo de los recursos hidrobiológicos de la ecoregión.