Las lagunas costeras tropicales se caracterizan por mantener una producción biológica primaria superior a las de otras aguas marinas tropicales, y en particular la CGSM. Se ha demostrado que la dinámica del nitrógeno y el fósforo generalmente limitan la producción biológica en dichos sistemas, y que el sedimento cumple un papel importante en esta dinámica, liberando o absorbiendo de la columna de agua cantidades importantes de ambos elementos. esta investigación pretendió implementar una metodología de bajo costo para determinar los flujos de amonio, nitrito, nitrato y ortofosfato disueltos y de nitrógeno y fósforo particulados, en la interfase agua – sedimento blando; describir y comparar el comportamiento de los flujos de acuerdo con las características estuarinas y de fuerte influencia de agua dulce, el período del día, y las épocas climáticas; y relacionar los flujos de nitrógeno y fósforo inorgánicos disueltos con la composición granulométrica y contenido de materia orgánica del sedimento. Se compararon dos métodos para medir los flujos de iones, uno ubicando en el fondo cámaras transparentes de acrílico, y el otro tomando núcleos de sedimento e incubándolos en el laboratorio. En ambos casos las concentraciones se midieron por métodos espectrofotométricos. El nitrógeno y fósforo particulados se midieron mediante trampas de sedimento que sirvieron para determinar el flujo hacia abajo y el flujo neto. Las determinaciones se realizaron, en una zona de la Ciénaga con influencia de aguas marinas (Isla Rosario-IR), y en otra con fuerte influencia de agua dulce (Río Sevilla – RS), en cuatro faenas de muestreo, marzo a mayo de 1996, septiembre de 1996, febrero de 1997 y mayo de 1997, abarcando todo el ciclo climático. En la comparación de métodos para flujos de iones, realizada durante la primera faena, se encontró que las cámaras de incubación aislan efectivamente el sedimento del agua adyacente, y que el fondo consume oxígeno a una tasa a la cual al cabo de seis horas alcanza niveles lo suficientemente bajos como para afectar los flujos que ocurren naturalmente. En este tiempo de incubación no se detectaron variaciones importantes en las especies químicas analizadas. Además, las cámaras fueron difíciles de manipular, requiriendo un gran número de muestras y un largo proceso de toma, transporte, almacenaje y procesamiento. También durante el proceso de incubación estuvieron sometidas a factores de difícil control como la estabilidad sobre el fondo según las características del sedimento y las condiciones climáticas. Las incubaciones por medio de los núcleos, en cambio, permitieron solucionar estos problemas y obtener una cuantificación de los flujos de las especies químicas consideradas; sin embargo, debe tenerse en cuenta que los valores obtenidos están referidos a las condiciones experimentales, las cuales difieren en grado incierto de las naturales.
Se recomienda usar Navas et al. (2003) y considerar el presente documento obsoleto.