Con el fin de observar la regeneración natural del manglar, durante la fase final de las obras hidráulicas y de reapertura del Caño Clarín, que comunican el río magdalena con la CGSM, se establecieron ocho sitios de muestreo sobre las márgenes de los caños Clarín (4 estaciones), Grande, Aguas Negras, Bristol y Dragado durante los meses de septiembre de 1997 a febrero de 1998. Las unidades muestrales tuvieron entre 1250 m² y 3000 m², perpendiculares al respectivo cuerpo de agua. En ellos se establecieron tres zonas diferenciadas por el desarrollo de la vegetación y se observaron la distribución, la tasa de crecimiento, el porcentaje de mortalidad y el reclutamiento de las plántulas de Avicennia germinans, Rhizophora mangle y Laguncularia racemosa. Se cartografió el área de estudio para establecer la distribución de las plántulas y los cambios de la vegetación. Las tasas de crecimiento y los porcentajes de sobrevivencia se obtuvieron de 20 individuos de cada especie en cada zona marcados en septiembre y que sobrevivieron hasta febrero. La densidad de plántulas se estimó por censos en lugares de baja densidad y de cuadrantes de 1m² en los de alta densidad al inicio y fin del trabajo de campo. Las diferencias y los cambios en el tiempo de las tasas de crecimiento de los individuos de cada especie se observaron a partir de análisis de varianza de medidas repetidas. Los datos biuológicos fueron relacionados con la salinidad del agua y del suelo, el nivel de inundación y la temperatura de los suelos en la superficie y a 5 cm. de profundidad. Las diferencias y posibles variaciones en el tiempo de las salinidades y de las temperaturas entre las zonas de las estaciones también se establecieron a partir de análisis de varianza de medidas repetidas. La salinidad del suelo varió significativamente entre zonas (p<0.05). Las registradas en el agua durante todo el tiempo y en todos las áreas de estudio fueron menores y las plántulas se distribuyeron con preferencia hacia las zonas más elevadas por los cuerpos de agua. El acño Clarin presentó los valores más altos en la salinidad del suelo (127,7o/oo y 129,5o/oo), en la zona intermedia entre el borde del cuerpo de agua y el interior (zona 3) se registraron bajas densidades de plántulas de las tres especies. Se encontraron diferencias significativas y cambios a través del tiempo (p<0.05) entre las zonas de las temperaturas a 5 cm. de profundidad y en superficie. Estas fueron mayores y determinaron la sobrevivencia de las plántulas de A. germinans. Las mayores inundaciones fueron en Aguas Negras, Dragado, Bristol y Caño Grande. Esta última permaneció inundada a pesar de la llegada de la época seca mayor. Se concluye que los flujos de agua, a partir de la rectificación concluida en enero de 1996, permitieron la colonización de plántulas en sitios poco inundados pero con buen lavado de los suelos, lo que posiblemente promovió altas tasas de crecimiento (Rinconada, Caño Grande y Km 17). Por otro lado, estas inundaciones incidieron en los porcentajes de sobrevivencia de las plántulas, disminuyendo las concentraciones salinas, salvo en las zonas 2 de los km 25 y km 13 (Caño Clarín). También promovieron el incremento de glicófitas y vegetación herbácea sobre este cuerpo de agua, las cuales invadieron zonas de manglares.
