La Ciénaga Grande de Santa Marta (CGSM), considerado por su producción biológica y tamaño (450 Km²) uno de los sistemas importantes de la cuenca Caribeña, presenta un avanzado estado de deterioro. Una de las actividades previstas para mejorar las condiciones del sistema, es la reapertura de canales de agua dulce. El presente trabajo se realizó para cuantificar el nivel de significación de los cambios ocurridos en los últimos años y para tener una línea base para determinar la tendencia del sistema, al implementar las obras civiles. Los análisis de salinidad del agua en los últimos 20 años y del seston en los últimos 6, mostraron tendencias al aumento. La intensa actividad pesquera, ha generado disminución en los bancos de ostra, en el número de especies de peces, talla de madurez sexual y número de individuos. La falta de manejo de los residuos agroindustriales y domésticos, ha permitido el ingreso permanente de contaminantes químicos y microbiológicos. La eutroficación ha conllevado al florecimiento de microalgas causantes de prolongadas hipoxias y la consecuente muerte masiva de peces. La mortandad del manglar, (27686 ha), se ha acelerado en los últimos seis años, estando cercana a 3 ha/día. Teniendo en cuenta que la CGSM es geológicamente joven (2000 años), los cambios presentados y la marcada tendencia al incremento de los mismos indican la pérdida de capacidad de amortiguamiento propia de estos ecosistemas.