Entre enero de 1997 y mayo de 1998 se realizaron 4 jornadas de muestreo de área barrida con el fin de hacer una caracterización fisicoquímica de la Ciénaga de Pajaral, Caribe colombiano, utilizando una técnica geoestadística que permite obtener una serie de mapas de isolíneas correspondientes a la distribución espacial de las variables escogidas. Se midieron (in situ): oxígeno, temperatura, salinidad, pH, profundidad del disco de Secchi. Adicionalmente se tomó una muestra de agua de superficie y otra de fondo para el posterior análisis de nutrientes, clorofila y seston en el laboratorio. Con los datos obtenidos en el citado análisis se aplicaron varias técnicas geoestadísticas (variogramas, modelos y Kriging) y se obtuvieron los mapas. Una vez obtenidos estos se realizó el análisis espacial y temporal de las variables como también una comparación que permitiera establecer cambios en el sistema desde la reapertura del Caño Clarín. En la Ciénaga de Pajaral se presentaron condiciones diferentes para cada una de las temporadas climáticas demostrando así que el régimen climático es determinante en la distribución de las variables fisicoquímicas en la Ciénaga de Pajaral. La distribución espacial de las variables reflejó las entradas de agua al sistema provenientes del Caño Clarín y de la Ciénaga Grande de Santa Marta. Se apreciaron cambios visibles en el tiempo a partir de la reapertura del Caño Clarín. Variables como la profundidad, el seston total, la clorofila a y la concentración de silicatos han aumentado considerablemente; mientras otras como la profundidad del disco de Secchi, las clorofilas b y c, y algunos nutrientes como nitritos y nitratos han presentado tendencias a disminuir.