Con el fin de determinar el nivel de contaminación de la mojarra rayada (Eugerres plumieri), en la Ciénaga Grande de Santa Marta y su medio hidrobiológico, el Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras (INVEMAR) dentro del programa calidad ambiental marina, quiso patrocinar un monitoreo mediante seis muestreos mensuales, desde mayo – octubre de 1998, tomando dos épocas climáticas; una lluviosa menor en los meses de mayo-junio y una época lluviosa mayor en septiembre-octubre. Se recogieron muestras de agua en siete estaciones (Rincoanada, Boca Caño Grande, Centro, Río Fundación, Río Aracataca, Río Sevilla, Boca de la Barra), estos lugares se escogieron por estar ubicados de tal forma que concentran los residuos procedentes del continente; en cada sitio de muestreo se midieron las variables salinidad y oxígeno disuelto. En el a´rea de estudio se compraron 120 mojarras a pescadores de diferentes lugares debido a la variación en su distribución espacial. Para cada animal se determinaron variables morfológicos longitud total y el peso. Para cada una de las muestras de agua y pez se realizó la cuantificación de coliformes totales, Escherichia coli, aerobios mesófilos, Staphylococcus aureus; y determinación cualitativa de Salmonella spp. Estos datos fueron procesados mediante el programa Stagraphics, con la finalidad de aplicar pruebas estadísticas como análisis de correlación entre las variables físico químicas y biológicas con el porcentaje presencia de las bacterias en el pez. Además, esta prueba se utilizó para relacionar el porcentaje presencia de las bacterias en el agua y en el pez. Los resultados microbiológicos realizados a las muestras del músculo de los peces recién capturados que no son estériles, al presentar promedios de mesófilos aeróbios 1.5×103 UFC/g, Staphylococcus aureus 4 UFC/g escherichia coli 1 UFC/g. En 66o/o de las muestras se observó presencia de Salmonella spp. superando en un 12o/o el presente en el agua. Todas las estaciones de agua se encontraron clasificadas en la tercera categoría considerada como prohibida para el cultivo de peces y ostras, por contener niveles por encima de 700 NMP/100ml coliformes totales y 140 NMP/100ml coliformes fecales. Se identificó S. aureus en todas las muestras de agua y peces, sólo en el mes de julio se encontró la presencia de Staphylococcus epidermidis. Este estudio permite concluir que la mojarra rayada de la Ciénaga Grande de Santa Marta no es apta para el consumo humano sin un tratamiento previo, por provenir de un área con alto grado de contaminación que influye en su calidad microbiológica.