Se registraron ca. 240 taxa distribuidos así: 37.6 % diatomeas pennadas, 19.8 % diatomeas céntricas, 14% dinoflagelados, 12.8% clorófitas, 8.6% euglenófitas y 7% cianofitas. 111 taxa se registraron como nuevas con respecto a la lista de especies hecha para el año 1987. El 41% del total de nuevos registros con respecto al año 1987 pertenecieron a formas de agua dulce, de los grupos de las clorófitas y eugienófitas; esto último debido a que el año 1995 fue más lluvioso que el año 1987. Se confirma la presencia de Alexandrium minutum Halim en la ciénaga, perteneciente a una familia de dinoflagelados con características neurotóxicas. El comportamiento de los diferentes grupos del fitoplancton, a lo largo del año 1995, fue semejante, en general, a aquel sucedido durante el año 1987. La concentración numérica de los diferentes grupos del fitoplancton estuvo muy incrementada durante 1995, si se compara con aquella durante el año 1987. El incremento de nutrientes dentro de la ciénaga pudo ser el causante de tal fenómeno. La diferencia del número de taxa entre los dos años muestreados, ca.270 (1987) vs. ca.240 (1995), no parece ser significativa como para constituir un fenómeno de reducción del número de taxa.
